Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms