Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AtminQ6P9S1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AtminQ6P9S1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AtminQ6P9S1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AtminQ6P9S1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AtminQ6P9S1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AtminQ6P9S1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AtminQ6P9S1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms