Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NesQ6P5H2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms