Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik3Q6P4S6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms