Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3D0

Nudt16, U8 snoRNA-decapping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt16Q6P3D0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt16Q6P3D0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt16Q6P3D0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudt16Q6P3D0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms