Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RbfaQ6P3B9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RbfaQ6P3B9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms