Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms