Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms