Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac4Q6NZM9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms