Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec23ipQ6NZC7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms