Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3bQ6NWW9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms