Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbxo41Q6NS60 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbxo41Q6NS60 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo41Q6NS60 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms