Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NipblQ6KCD5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NipblQ6KCD5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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