Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm4Q6IRU2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms