Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ParpbpQ6IRT3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms