Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms