Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw2Q6I6G8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw2Q6I6G8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Hecw2Q6I6G8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw2Q6I6G8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw2Q6I6G8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw2Q6I6G8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw2Q6I6G8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw2Q6I6G8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw2Q6I6G8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms