Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KdsrQ6GV12 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KdsrQ6GV12 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms