Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edrf1Q6GQV7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms