Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Smarca2Q6DIC0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Smarca2Q6DIC0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms