Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp7Q6A4J8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Usp7Q6A4J8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp7Q6A4J8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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