Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Cep290Q6A078 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Cep290Q6A078 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep290Q6A078 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Cep290Q6A078 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Cep290Q6A078 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Cep290Q6A078 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Cep290Q6A078 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Cep290Q6A078 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Cep290Q6A078 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Cep290Q6A078 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep290Q6A078 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep290Q6A078 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.8 ms