Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmcc1Q69ZZ6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms