Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim24Q64127 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms