Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pan3Q640Q5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pan3Q640Q5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms