Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col4a5Q63ZW6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a5Q63ZW6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms