Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms