Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20854Q62461 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20854Q62461 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20854Q62461 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20854Q62461 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20854Q62461 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20854Q62461 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms