Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20865Q62460 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20865Q62460 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm20865Q62460 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm20865Q62460 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm20865Q62460 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20865Q62460 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20865Q62460 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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