Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sp4Q62445 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms