Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms