Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa13Q62424 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa13Q62424 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms