Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrhQ62361 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrhQ62361 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrhQ62361 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TrhQ62361 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrhQ62361 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrhQ62361 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrhQ62361 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TrhQ62361 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrhQ62361 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TrhQ62361 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms