Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim28Q62318 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim28Q62318 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms