Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctr9Q62018 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms