Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Npm1Q61937 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Npm1Q61937 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms