Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcna6Q61923 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna6Q61923 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna6Q61923 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna6Q61923 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna6Q61923 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna6Q61923 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcna6Q61923 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms