Protein–RNA interactions for Protein: Q61850

Foxc2, Forkhead box protein C2, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxc2Q61850 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxc2Q61850 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxc2Q61850 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms