Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga6Q61739 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itga6Q61739 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms