Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1aQ61495 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms