Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msi1Q61474 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msi1Q61474 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms