Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf9Q61179 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms