Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4bQ61136 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4bQ61136 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms