Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamb3Q61087 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms