Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxd3Q61060 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd3Q61060 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms