Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxg1Q60987 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms