Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Meis1Q60954 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms