Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms