Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot7Q60809 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot7Q60809 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms