Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbibQ60778 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NfkbibQ60778 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms